衢州市妇幼保健院创建于1952年，是一所集医疗、保健、教学、科研于一体的二级甲等妇幼保健院。医院是衢州市妇幼保健业务指导中心、产科急救管理中心、新生儿急救中心、新生儿疾病筛查管理中心、产前诊断中心、生殖医学中心。现设6个病区，开放床位300张，职工400余人。 近年来，医院积极与上级医院合作，目前是浙江大学医学院附属儿童医院衢州分院、浙江大学医学院附属妇产科医院协作医院、复旦大学附属妇产科医院技术指导单位。 妇产科建有浙江大学医学院附属妇产科医院林俊院长专家工作站，“妇产科学暨生殖医学科技创新团队”是衢州市重点创新团队。妇科开设有宫颈疾病、不孕不育等专科门诊，开展各类妇科腹腔镜、宫腔镜微创手术；产科是衢州市医学重点建设学科，具备一支技术过硬的抢救队伍，每年接诊的对象中10%为各县（市、区）转诊的高危孕产妇，对羊水栓塞、凶险性前置胎盘、重型胎盘早剥、重度子痫前期等危重孕产妇的救治水平居全市领先；生殖医学中心是衢州首家获得资质的辅助生育机构，在治疗不孕症、复发性流产及生殖内分泌疾病等方面领跑全市；产前诊断（筛查）中心是衢州市唯一一家有资质的产前诊断机构，在预防出生缺陷、提升人口素质方面发挥了重要作用。 儿科中心建有浙江大学医学院附属儿童医院杜立中院长专家工作站。新生儿科是衢州市医学重点学科，其新生儿监护中心在全市最早开展肺表面活性物质应用、高频振荡呼吸机应用，对新生儿呼吸衰竭、持续肺动脉高压、极低体重儿管理等各种危重症的救治和监护达到省内先进水平；儿内科开展性早熟、矮小症、儿童肥胖症等特色诊疗，病源已辐射至江西、福建等地。 儿童保健科是衢州市医学重点建设学科，开展生长发育监测、儿童心理、儿童营养保健等服务，专业致力于保障和促进儿童的全面发展；妇女保健科以群体保健和个体保健相结合，开展孕前、孕期、青春期、更年期保健，优生优育咨询和产后康复等服务。医院作为首批“浙江省儿童早期发展示范基地”，一直将儿童早期发展作为一项重要任务不断推进，并在区域内起学科带头作用。 作为临床医生的“眼睛”，检验科、超声科、放射科、病理科等医技科室相互协作，爱岗敬业，为临床诊疗提供有力保障。 2016年4月，医院牵手全市6家县（市、区）妇幼保健院，成立衢州市首家医疗联合体——“衢州妇幼医院集团”，更是推动衢州市妇幼保健事业整体发展的重大举措。 医院遵照市委、市政府关于加速妇幼卫生事业健康发展的指导精神，在“十三五”规划期内，将按三级妇幼保健院标准完成医院迁建项目。项目占地35249㎡，总建筑面积76232㎡，计划2019年底投入使用。这将使医院的服务能力得到跨越式的发展。